Scienza in laboratorio | Una nuova era di NIPT: Test prenatale non invasivo per le malattie monogeniche
Il DNA svolge un ruolo cruciale nella crescita e nello sviluppo umano. Quando i danni al DNA causati da fattori ambientali esterni non possono essere riparati, possono insorgere malattie e trasmissione di alterazioni genetiche alle generazioni future. I disturbi genetici umani si suddividono in quattro grandi categorie: cromosomici, monogenici, poligenici e mitocondriali. Sebbene la maggior parte delle malattie monogeniche sia rara, la loro incidenza complessiva raggiunge circa il 2%–3%.
Prevenzione e controllo delle malattie monogeniche
Le strategie di prevenzione e controllo delle malattie monogeniche vengono applicate in diverse fasi della vita.
- Preconcezione
La consulenza genetica e i test genetici preimpianto per malattie monogeniche (PGT-M) possono ridurre il rischio di trasmettere malattie ereditarie. Tuttavia, il PGT-M è costoso e complesso e, nella maggior parte dei casi, è comunque consigliata la diagnosi prenatale.
- Prenatale
Per le donne con risultati ecografici o sierologici anomali, sono ancora necessari test diagnostici invasivi come villocentesi, amniocentesi o cordocentesi. Queste procedure, però, comportano un rischio di aborto spontaneo di circa l’1%.
- Neonato
Lo screening genetico neonatale consente l’individuazione precoce di malattie ereditarie e l’attuazione di misure preventive tempestive..
Test prenatale non invasivo per le malattie monogeniche
I recenti progressi nella tecnologia di sequenziamento hanno reso possibile l’utilizzo del DNA fetale libero circolante (cfDNA) per lo screening precoce delle malattie monogeniche. Sono state sviluppate diverse tecniche, tra cui microarray, PCR digitale, RT-PCR, analisi del dosaggio relativo delle mutazioni (RMD), analisi del dosaggio aplotipico relativo (RHDO) e sequenziamento ad alta processività (NIPT-SGD), tutte finalizzate a una diagnosi non invasiva. Tra queste, l’analisi RHDO e l’NIPT-SGD sono particolarmente efficaci nell’identificazione delle mutazioni de novo, in quanto non dipendono da test specifici per variante.
L’analisi RHDO utilizza polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) per ricostruire gli aplotipi dei genitori e del probando; successivamente, i dati di sequenziamento del cfDNA vengono analizzati per determinare se il feto ha ereditato alleli ad alto rischio. L’NIPT-SGD, invece, cattura direttamente esoni chiave, introni e giunzioni esone–introne dal cfDNA materno tramite sequenziamento mirato. Questo metodo può analizzare da 1 a 100 malattie in un unico test, non richiede il DNA paterno ed è caratterizzato da maggiore sensibilità e produttività rispetto agli approcci tradizionali.
NIPT-SGD vs. NIPT
Sia l’NIPT sia l’NIPT-SGD si basano sul cfDNA, ma differiscono per ambito e metodologia. L’NIPT-SGD è progettato per rilevare mutazioni negli esoni e nelle giunzioni esone–introne, mentre l’NIPT e l’NIPT Plus utilizzano il sequenziamento dell’intero genoma a bassa profondità, rilevando principalmente anomalie cromosomiche. Per individuare microdelezioni o microduplicazioni cromosomiche è necessario un arricchimento mirato e una maggiore profondità di sequenziamento.
| Tipo di test | Malattie rilevate | Numero di malattie | Metodologia | Profondità di sequenziamento | Numero di letture |
Tecniche |
| NIPT-SGD | Malattie monogeniche dominanti | 1–100 | Cattura mirata + sequenziamento ad alta processività | >200× | >20M | cfDNA, NGS |
| NIPT | Aneuploidie (T21, T18, T13) | Poche | Sequenziamento dell’intero genoma a bassa profondità | ~0,1× | 3,5–5M | Cariotipo |
| NIPT Plus | Aneuploidie + microdelezioni/duplicazioni cromosomiche | ~100 | Sequenziamento dell’intero genoma a bassa profondità | ~0,4× | 15–25M | Cariotipo, CNV, CMA |
i nostri Prodotti per la ricerca NIPT-SGD
Noi forniamo materiali affidabili per l’estrazione del cfDNA, la preparazione di librerie, la cattura mirata e i flussi di lavoro di sequenziamento. I nostri prodotti supportano le più recenti innovazioni in ambito di salute riproduttiva e contribuiscono al miglioramento della cura prenatale e postnatale.
- Estrazione del DNA: VAHTS Serum/Plasma Circulating DNA Kit
- Preparazione di librerie per Illumina: VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit V2
- Preparazione di librerie per MGI: VAHTS Universal DNA Library Prep Kit V4 e VAHTS Universal DNA Library Prep Kit for MGI
- Preparazione di librerie per Ion Torrent: VAHTS Universal DNA Library Prep Kit V2 e VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2
- Cattura mirata: VAHTS AmpSeq Library Prep Kit V3, VAHTS Target Capture Hybridization and Wash Kit, VAHTS Target Capture Core Exome Panel, VAHTS Target Capture Universal Blockers and Post-PCR Primer Mix.
- Beads e kit di quantificazione: VAHTS DNA Clean Beads (Cat. N411), Equalbit 1× dsDNA HS Assay Kit.
- Adattatori: VAHTS Multiplex Oligos Set 4/Set 5 per Illumina.